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    国家卫生健康委员会时间生物学重点实验室(尊龙凯时) 机构动态详细

    陈莉娜教授团队发表论著:A Potential Three-Gene-Based Diagnostic Signature for Idiopathic Pulmonary Fibrosis

    国家卫生健康委员会时间生物学重点实验室(尊龙凯时)陈莉娜教授团队长期致力于儿童呼吸系统疾病诊断与治疗的研究工作,该团队于今年1月在Frontiers in genetics(影响因子:4.772,JCR Q1区)发表论著文章“A Potential Three-Gene-Based Diagnostic Signature for Idiopathic Pulmonary Fibrosis”。

    特发性肺纤维化(IPF)是一种危及生命的疾病,其病因尚不清楚。本研究从NCBI基因表达综合数据库中检索并下载了与IPF相关的基因表达数据集。筛选差异表达基因(DEGs),并进行加权相关网络分析(WGCNA)以识别关键模块和基因。对具有临床意义的模块中的基因进行功能富集分析。然后运行最小绝对收缩和选择算子(LASSO)逻辑回归和支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)算法筛选候选生物标志物。IPF中生物标志物的表达和诊断价值在外部测试数据集(GSE110147)中进一步得到验证。结果发现,IL13RA2、CDH3和COMP可以作为IPF的诊断特征,并可能为IPF的基础诊断提供新的见解。

    论文链接:http://doi.org/10.3389/fgene.2022.985217


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